Футбольный клуб Новосибирска был основан в 1934 году и в разное время носил названия - "Крылья Советов", "Сибэлектротяжмаш", "Дзержинец", "Чкаловец" и "Сибирь". По итогам сезона 2018/2019 команда заняла 18-е место в турнирной таблице ФНЛ. После этого клуб был расформирован из-за банкротства, а в январе 2023 года постановлением Арбитражного суда Новосибирской области - ликвидирован. Заявление о банкротстве "Сибири" подал стадион "Спартак", площадями которого пользовался клуб (у руководства стадиона неоднократно возникали претензии к ФК).
В июне 2019 года власти региона приняли решение учредить некоммерческую организацию "Футбольный клуб "Новосибирск", в которую перешло большинство сотрудников "Сибири", учредителем нового клуба стала Новосибирская область в лице министерства физической культуры и спорта региона.